Name: Konferencja Użytkowników Komputerów Dużej Mocy - KUKDM 2023
Start: 2023-04-19T14:30:00+02:00
End: 2023-04-21T15:30:00+02:00
Location: Zakopane

Konferencja Użytkowników Komputerów Dużej Mocy - KUKDM 2023

from Wednesday 19 April 2023 (14:30) to Friday 21 April 2023 (15:30)

Monday 17 April 2023
Tuesday 18 April 2023
Wednesday 19 April 2023
15:00 Training: Effective Use of HPC in Research Utilizing Machine Learning - Szymon Mazurek (ACK Cyfronet AGH) Marcin Pietroń (ACK Cyfronet AGH) Michał Karwatowski (ACK Cyfronet AGH) Klemens Noga (ACK Cyfronet AGH) Maciej Wielgosz (ACK Cyfronet AGH)
Training: Effective Use of HPC in Research Utilizing Machine Learning
- Szymon Mazurek (ACK Cyfronet AGH)
- Marcin Pietroń (ACK Cyfronet AGH)
- Michał Karwatowski (ACK Cyfronet AGH)
- Klemens Noga (ACK Cyfronet AGH)
- Maciej Wielgosz (ACK Cyfronet AGH)
15:00 - 19:30
Termin: środa 19 kwietnia 2023, 15:00-19:30, z przerwą kawową po ok. 2 godzinach od rozpoczęcia. Zagadnienia: Szkolenie jest przeznaczone dla osób planujących efektywne wykorzystanie zasobów Komputerów Dużej Mocy zainstalowanych w Cyfronecie do badań wykorzystujących uczenie maszynowe. Jest skierowane do użytkowników, którzy chcieliby jak najszybciej zdobyć praktyczną wiedzę pozwalającą na samodzielną pracę z własnymi zbiorami, przy wykorzystaniu najpopularniejszych dzisiaj narzędzi do eksploracji danych. W ramach szkolenia uczestnicy zostaną wprowadzeni w zagadnienia programowania sieci neuronowych z wykorzystaniem języka Python. Szkolenie składać się będzie z trzech modułów: 1. Wprowadzenie teoretyczne, w którym krótko zostaną przedstawione podstawowe zagadnienia. 2. Praktyczne ćwiczenia z przetwarzaniem obrazów za pomocą gotowych modeli sieci głębokich dla zagadnienia klasyfikacji obrazów. 3. Praktyczne wskazówki jak dostosować strategie uczenia maszynowego do zasobów HPC, w tym sposoby efektywnego ładowania danych, doboru parametrów treningu oraz rozpraszania uczenia. Dodatkowo zostanie pokazane wykorzystanie narzędzi MLOps w celu monitorowania efektywności obliczeń. Podczas szkolenia przedstawione zostaną podstawowe problemy dotyczące uczenia maszynowego (np. przygotowanie danych, dobór algorytmów, podstawowe algorytmy, etc.). Część praktyczna prowadzona będzie w formie warsztatowej. Na zakończenie szkolenia przewidziane jest 30-60 min. zajęć indywidualnych, podczas których uczestnicy będą mieli okazję wykonać ze wsparciem instruktorów mały projekt związany z tematyką poruszaną na szkoleniu.
Thursday 20 April 2023
09:00 Session 1
09:00 - 10:50
Contributions

09:00 Conference Opening

09:10 Cyfronet - Moc dla polskiej nauki - Kazimierz Wiatr

09:50 Artificial Intelligence and Intensive Numerical Simulations for Heavy Industry by using High-Performance Computing - Łukasz Rauch

10:20 Applied Artificial Intelligence, Health Science and Case of Predicting Orthostatic Intolerance in Older Persons - Matej Mertik
10:50 Coffee break
Coffee break
10:50 - 11:15
11:15 Session 2
11:15 - 13:00
Contributions

11:15 Ab Initio Molecular Dynamics Studies of Hydrogen Bonding and IR Spectra in EMIM-TFSI/H2O Systems - Piotr Wróbel

11:30 Vibrational Spectra from Molecular Dynamics: Seeking for an Efficient Computational Method - Andrzej Eilmes

11:45 Computational Modeling of Intermolecular Interactions in Supramolecular Crystals: Towards Automated Explorations of Chemical Spaces - Grzegorz Niedzielski

12:00 Molecular Modeling of Cisplatin Derivatives: the Relationship Between Structure and Potential Bioactivity - Wojciech Łach

12:15 Solvent Molecules Impact on the Nylon 6 Thermal Degradation Process: the Ab Initio Molecular Dynamics and DFT Study - Yuliia Didovets

12:30 Molecular Modeling of Selected Perovskites with Possible Application in Photovoltaics - Alicja Mikłas

12:45 Computational Studies on Structural and Photophysical Properties of a 2,4-Dihydroxyphenyl-Substituted 1,3,4-Thiadiazole - Dominika Kaczmarczyk
13:00 Lunch
Lunch
13:00 - 14:00
14:00 Session 3
14:00 - 15:45
Contributions

14:00 The Strategy of a Living Organism – the Simulation Model - Irena Roterman

14:15 Molecular Dynamics Simulations for the Michaelis Complex of Ectoine Synthase (EctC) - Justyna Andrys-Olek

14:30 Advances in the System for the Automatic Dogs’ Skin Cancer Detection - Rafał Frączek

14:45 Sonochemical Formation of Fluorouracil Nanoparticles: Toward Controlled Drug Delivery from Polymeric Surfaces - Piotr Kubisiak

15:00 Computational Studies of Potential Mechanisms for Inhibiting the Toxicity of Amphotericin B via Molecular Association - Mikołaj Gurba

15:15 Hybrid-Kinetic Simulations of Quasi-perpendicular Shocks in High Beta Cosmic Plasmas - Stella Boula

15:30 Particle-In-Cell Simulation of the Leptons Acceleration in the Precursor of Young Supernova Remnant Shock - Oleh Kobzar
15:45 Coffee break
Coffee break
15:45 - 16:05

16:05 Panel discussion session

16:05 - 17:35

19:30 Dinner

19:30 - 22:00
Friday 21 April 2023
09:00 Sponsors' Session
09:00 - 10:10
Contributions

09:00 HPC&AI trends and strategy @ HPE - Marc Simon (HPE HPC technical advisor)

09:30 Procesory i akceleratory AMD do superkomputerów - Krzysztof Łuka (FAE & Business Development, AMD) Robert Gorajek (Enterprise Business Development Executive, CEE, AMD)

09:50 Accelerated High Performance Computing in the Exascale Era - Jean-Pierre Panziera (CTO for HPC, Atos)
10:10 Coffee break
Coffee break
10:10 - 10:30
10:30 Session 4
10:30 - 12:15
Contributions

10:30 Differences Between Vibrational Wavepackets Generated via Singlet Fission and Those Shaped by Direct Raman Pumping - Grzegorz Mazur

10:45 Particle Transport Simulation for the Personalized Radiotherapy - Leszek Grzanka

11:00 Improving Hip Dysplasia Diagnosis in Dogs through Augmented 3D Video Simulation - Krystian Strzałka

11:15 Development of the Machine Learning Based Track Reconstruction in the MUonE Experiment - Miłosz Zdybał

11:30 Deep Neural Networks for the Calibration of Timing Detectors - Mateusz Kocot

11:45 Neural Networks for the Analysis of Particle Tracing in PIC Simulations - Gabriel Torralba Paz

12:00 Dog Gait Assessment Using Temporal Graph Neural Networks - Szymon Mazurek
12:15 Coffee break
Coffee break
12:15 - 12:35
12:35 Session 5
12:35 - 14:20
Contributions

12:35 Do Cohort Studies in Diffusion MRI Require a Marriage of Convenience with High-Performance Computing? A Case Study - Julia Machnio

12:50 Classification of Images of Cytological Samples for the Purposes of Initial Analysis - Jan Krupiński

13:05 Leveraging ACC Resources for Medical Research - Piotr Nowakowski

13:20 Towards Observability in Scientific Computing - Bartosz Baliś

13:35 UWLCM - Eulerian-Lagrangian Cloud Model for Heterogeneous Computing Clusters - Piotr Dziekan

13:50 Unsupervised Detection of Decoupled Subspaces in the Quantum Hilbert Space - Tomasz Szołdra

14:05 Scalability of a Neuroevolutionary Based Framework for Anomaly Detection - Marcin Pietroń
14:20 Closing

14:20 - 14:30

14:30 Lunch
Lunch
14:30 - 15:30

Choose timezone